Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LgsnQ8CIX8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LgsnQ8CIX8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms