Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam20aQ8CID3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam20aQ8CID3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam20aQ8CID3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam20aQ8CID3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms