Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog3Q8CI04 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog3Q8CI04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog3Q8CI04 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog3Q8CI04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms