Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ep400Q8CHI8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ep400Q8CHI8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Ep400Q8CHI8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ep400Q8CHI8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ep400Q8CHI8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms