Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vcpip1Q8CDG3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcpip1Q8CDG3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcpip1Q8CDG3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms