Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bcas3Q8CCN5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcas3Q8CCN5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcas3Q8CCN5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcas3Q8CCN5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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