Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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