Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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