Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rassf4Q8CB96 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf4Q8CB96 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf4Q8CB96 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf4Q8CB96 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rassf4Q8CB96 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf4Q8CB96 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rassf4Q8CB96 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf4Q8CB96 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rassf4Q8CB96 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rassf4Q8CB96 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rassf4Q8CB96 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rassf4Q8CB96 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rassf4Q8CB96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rassf4Q8CB96 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms