Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp9Q8CAS9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp9Q8CAS9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp9Q8CAS9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp9Q8CAS9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Parp9Q8CAS9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Parp9Q8CAS9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Parp9Q8CAS9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms