Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc186Q8C9S4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc186Q8C9S4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms