Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa22Q8C1N8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms