Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csgalnact2Q8C1F4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Csgalnact2Q8C1F4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Csgalnact2Q8C1F4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms