Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ttc21aQ8C0S4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ttc21aQ8C0S4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ttc21aQ8C0S4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21aQ8C0S4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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