Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrd1Q8C0R9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrd1Q8C0R9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrd1Q8C0R9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrd1Q8C0R9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.6 ms