Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim47Q8C0E3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim47Q8C0E3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim47Q8C0E3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim47Q8C0E3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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