Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx22Q8C084 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.2 ms