Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6ka5Q8C050 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6ka5Q8C050 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka5Q8C050 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka5Q8C050 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rps6ka5Q8C050 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms