Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdf3Q8BYK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ythdf3Q8BYK6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdf3Q8BYK6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf3Q8BYK6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms