Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec22cQ8BXT9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sec22cQ8BXT9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22cQ8BXT9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms