Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfrp1Q8BXL7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfrp1Q8BXL7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arfrp1Q8BXL7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arfrp1Q8BXL7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfrp1Q8BXL7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfrp1Q8BXL7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfrp1Q8BXL7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms