Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,05■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15,02■□□□□ -0
5730596B20RikQ8BQ08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,02□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15,01□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15,01□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,01□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC14,99□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,98□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14,96□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14,96□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14,96□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,93□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,92□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,92□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,92□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,92□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14,92□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,92□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,91□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,91□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14,91□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,91□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC14,91□□□□□ -0,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,8 ms