Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acbd3Q8BMP6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acbd3Q8BMP6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acbd3Q8BMP6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms