Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gga3Q8BMI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gga3Q8BMI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga3Q8BMI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms