Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PolrmtQ8BKF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PolrmtQ8BKF1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PolrmtQ8BKF1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolrmtQ8BKF1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms