Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg4dQ8BGV9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4dQ8BGV9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4dQ8BGV9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms