Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Best2Q8BGM5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Best2Q8BGM5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Best2Q8BGM5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms