Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AW551984Q8BGF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AW551984Q8BGF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms