Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sptlc3Q8BG54 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sptlc3Q8BG54 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sptlc3Q8BG54 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptlc3Q8BG54 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptlc3Q8BG54 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptlc3Q8BG54 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptlc3Q8BG54 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sptlc3Q8BG54 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sptlc3Q8BG54 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sptlc3Q8BG54 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sptlc3Q8BG54 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms