Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sv2bQ8BG39 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sv2bQ8BG39 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sv2bQ8BG39 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sv2bQ8BG39 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sv2bQ8BG39 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sv2bQ8BG39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sv2bQ8BG39 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sv2bQ8BG39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sv2bQ8BG39 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sv2bQ8BG39 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sv2bQ8BG39 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms