Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmtc4Q8BG19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmtc4Q8BG19 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.8 ms