Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ctdspl2Q8BG15 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdspl2Q8BG15 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms