Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc172Q810N9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc172Q810N9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc172Q810N9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms