Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Liat1Q810M6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Liat1Q810M6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Liat1Q810M6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Liat1Q810M6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms