Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp8Q80YR6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8Q80YR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms