Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc1Q80VQ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc1Q80VQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc1Q80VQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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