Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sestd1Q80UK0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sestd1Q80UK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sestd1Q80UK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms