Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Otop3Q80UF9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Otop3Q80UF9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Otop3Q80UF9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Otop3Q80UF9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms