Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ube3cQ80U95 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube3cQ80U95 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube3cQ80U95 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube3cQ80U95 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ube3cQ80U95 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3cQ80U95 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube3cQ80U95 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ube3cQ80U95 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ube3cQ80U95 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms