Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnf1Q7TSH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnf1Q7TSH7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnf1Q7TSH7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnf1Q7TSH7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 501.9 ms