Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LnpkQ7TQ95 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LnpkQ7TQ95 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.6 ms