Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn1Q7TPR4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn1Q7TPR4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn1Q7TPR4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms