Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SugctQ7TNE1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SugctQ7TNE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms