Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17leQ7M764 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17leQ7M764 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17leQ7M764 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17leQ7M764 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17leQ7M764 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp17leQ7M764 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17leQ7M764 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp17leQ7M764 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms