Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc25Q78PG9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc25Q78PG9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc25Q78PG9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms