Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GypcQ78HU7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GypcQ78HU7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GypcQ78HU7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GypcQ78HU7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GypcQ78HU7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GypcQ78HU7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GypcQ78HU7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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