Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpv1Q704Y3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpv1Q704Y3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpv1Q704Y3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms