Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nemp1Q6ZQE4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nemp1Q6ZQE4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms