Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efr3bQ6ZQ18 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efr3bQ6ZQ18 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms