Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot1Q6ZQ08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot1Q6ZQ08 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms